1998年6月学校成立基础部，下设教育心理教研室、教育技能教研室、青年心理咨询中心、教育技能研究所和一个少数民族预科班、两个中师班。1999年6月15日省教委批准开设小学教育文科、理科专业，同年招生104人，2000年2月成立小学教育系，2000年12月，经省教育厅批准设立学前教育和心理健康教育（2002年改为应用心理学专业）两个专业，并于2001年正式招生。2004年2月，取消原基础部、小教系建制，更名为教育系，2005年12月再次更名为教育科学系。我系原有小学教育专业（文科和理科）、学前教育专业、应用心理学专业、五年制专科小学教育文、理专业，经教育部批准于2006年秋季招收小学教育文科、理科本科学生，并开办彝汉、苗汉两个双语教学专科班。2007年经教育部批准设立学前教育（本科），特殊教育（专科）两个专业，并于2008年开始招生。截止2008年11月，教育科学系共有28个教学班，全日制普通班学生总数达1258人。已毕业专科学生六届共1000余人。
教育科学系设有教育学教研室、心理学教研室、综合教研室三个教研室，设有毕节试验区教育研究所以及心理咨询中心等科研机构和社会服务机构，还有学生山泉写作社、秋水文学社、彝学研究社、龙泉书画协会、学生艺术团
、心理协会、推普协会等七个学生社团。系党总支下设教工党支部、学生党支部。
现有图书资料4000余册，心理实验室1个。
全系有在职教职工37人，其中教授1人，副教授6人，讲师10人；硕士15人，本科学历22人。50岁以上2人，40-50岁6人，30-40岁16人，20-30岁13人。有地管专家1人、地区专业技术拔尖人才1人、学院学科带头人2人。
教育科学系教师在《毕节学院学报》及以上刊物发表论文100余篇，著作1部，参编教材6部，已经完成和正在进行的科研课题20余项，有30余项科研成果获地区以上奖励。
开设的主要课程有：基础汉语、文学概论、儿童文学、高等数学、初等数论、小学语文教学论、小学数学教学论、教育原理、学前心理学、学前教育学、学前卫生学、普通心理学、发展心理学、教育心理学、人格心理学、变态心理学、社会心理学、管理心理学、心理咨询、心理测量、毕业论文及答辩。
本部门职责：积极承担为毕节试验区基础教育培养合格师资的任务和教师培训任务。除承担小学教育专业、学前教育专业、应用心理学专业的专业课、专业基础课、特设课、选修课十余门外，还承担全校公共教育学、心理学的教学。
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